すべてダウンロードしたファイルはアップロードできているはずなのにも関わらず、「行の挿入、行の追加、列の挿入、列の追加」ボタンが表示されませんでした。
そこでこれらの画像が入っているフォルダ（mt-static/TinyMCEforMT/js/tiny_mce/plugins/table/images/）を確認すると、以下の画像の名前のファイルがありました。
- table_insert_col_after.gif100666
- table_insert_col_before.gif00666
- table_insert_row_after.gif100666
- table_insert_row_before.gif00666
ダウンロードするときに化けてしまったのでしょうか？
ファイル名の「00666」などの数字を削除すると問題なく使うことができるようになりました。
他には以下のフォルダにも同様の状態になっている画像ファイルがありました。
・mt-static/TinyMCEforMT/js/tiny_mce/plugins/emotions/images
・mt-static/TinyMCEforMT/js/tiny_mce/plugins/inlinepopups/images
・mt-static/TinyMCEforMT/js/tiny_mce/plugins/searchreplace/images
・mt-static/TinyMCEforMT/js/tiny_mce/plugins/xhtmlxtras/images
なぜだかTinyMCE Plugin for Movable Type1.20Jaのボタンが表示されない～！という方はぜひチェックしてみてください。